Von einer manuellen Bearbeitung der sqlite kann nur dringend abgeraten werden. Es ist einfach, die Daten zu "manipulieren". Es ist nicht einfach, die ICS changes (journal) anzupassen.
Der angesprochene Fall ist hier dokumentiert: https://docs.grommunio.com/man/gromox-kdb2mt.8gx.html?highlight=zarafa#zarafa-address-type
Die genannten "Fehler" sind keine Fehler, diese Informationen können leider nicht verarbeitet werden, wie in der Dokumentation geschildert. Es ist aus MAPI-technischer Betrachtung "bad practice", einen eigenen Transport-Type vorzuhalten. Hierzu sollte man sich an Zarafa oder Kopano wenden.
Ich habe die Frage an den Hauptentwickler des Tools weitergeleitet, vielleicht sieht er einen Weg, eine solche Konversion durchzuführen.